Можно ли заниматься бегом при таких диагнозах, как открытое овальное окно, аритмия и варикоз?

Перечисленные вами состояния бывают разной степени выраженности, и, соответственно, рекомендации при разной степени тяжести будут разными.

Для получения точного ответа необходима консультация врача-кардиолога или врача лечебной физкультуры.